Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PHF3Q92576 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms