Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms