Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAAF4Q8WXU2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms