Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms