Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
TRIM41Q8WV44 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRIM41Q8WV44 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
TRIM41Q8WV44 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRIM41Q8WV44 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRIM41Q8WV44 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
TRIM41Q8WV44 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRIM41Q8WV44 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRIM41Q8WV44 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRIM41Q8WV44 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRIM41Q8WV44 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRIM41Q8WV44 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRIM41Q8WV44 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRIM41Q8WV44 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRIM41Q8WV44 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRIM41Q8WV44 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRIM41Q8WV44 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRIM41Q8WV44 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRIM41Q8WV44 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRIM41Q8WV44 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
TRIM41Q8WV44 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
TRIM41Q8WV44 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
TRIM41Q8WV44 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRIM41Q8WV44 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRIM41Q8WV44 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRIM41Q8WV44 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRIM41Q8WV44 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRIM41Q8WV44 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRIM41Q8WV44 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
TRIM41Q8WV44 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRIM41Q8WV44 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRIM41Q8WV44 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRIM41Q8WV44 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms