Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF3IP1Q8TDR0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF3IP1Q8TDR0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF3IP1Q8TDR0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF3IP1Q8TDR0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF3IP1Q8TDR0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF3IP1Q8TDR0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF3IP1Q8TDR0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF3IP1Q8TDR0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF3IP1Q8TDR0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF3IP1Q8TDR0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF3IP1Q8TDR0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF3IP1Q8TDR0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF3IP1Q8TDR0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF3IP1Q8TDR0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF3IP1Q8TDR0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms