Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms