Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP38Q8NB14 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms