Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZIC4Q8N9L1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms