Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP3Q8IZU3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms