Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP43Q70EL4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms