Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP31Q70CQ4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
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