Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms