Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms