Protein–RNA interactions for Protein: Q6RVD6

SPATA8, Spermatogenesis-associated protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA8Q6RVD6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SPATA8Q6RVD6 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms