Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL35Q6PF15 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms