Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6P435 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6P435 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6P435 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6P435 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6P435 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6P435 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6P435 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6P435 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6P435 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6P435 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6P435 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6P435 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6P435 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6P435 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6P435 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6P435 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6P435 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6P435 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6P435 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6P435 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6P435 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6P435 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6P435 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6P435 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6P435 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6P435 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6P435 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6P435 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6P435 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6P435 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6P435 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6P435 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6P435 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6P435 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6P435 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6P435 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6P435 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6P435 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6P435 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6P435 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6P435 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6P435 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6P435 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6P435 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6P435 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6P435 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6P435 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6P435 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6P435 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6P435 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6P435 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6P435 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6P435 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6P435 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6P435 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6P435 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6P435 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6P435 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6P435 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6P435 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q6P435 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6P435 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6P435 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6P435 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6P435 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6P435 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6P435 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6P435 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6P435 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6P435 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6P435 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6P435 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6P435 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6P435 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6P435 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6P435 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6P435 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6P435 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6P435 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6P435 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6P435 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6P435 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6P435 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6P435 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6P435 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6P435 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6P435 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6P435 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6P435 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6P435 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6P435 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6P435 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6P435 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6P435 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6P435 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6P435 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6P435 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6P435 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6P435 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms