Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms