Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSAPQ6IQ19 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSAPQ6IQ19 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSAPQ6IQ19 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSAPQ6IQ19 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSAPQ6IQ19 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSAPQ6IQ19 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSAPQ6IQ19 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSAPQ6IQ19 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSAPQ6IQ19 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSAPQ6IQ19 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSAPQ6IQ19 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms