Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC102BQ68D86 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms