Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms