Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 CLCN5-205ENST00000482218 449 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 AIRN-202ENST00000609176 1489 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 LINC01108-202ENST00000635227 776 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 LINC00469-201ENST00000321800 708 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms