Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf135Q5VTT2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms