Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PXDC1Q5TGL8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms