Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms