Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms