Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC158Q5M9N0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms