Protein–RNA interactions for Protein: Q562R1

ACTBL2, Beta-actin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBL2Q562R1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBL2Q562R1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms