Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms