Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GREB1Q4ZG55 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GREB1Q4ZG55 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms