Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms