Protein–RNA interactions for Protein: Q2M296

MTHFSD, Methenyltetrahydrofolate synthase domain-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFSDQ2M296 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
MTHFSDQ2M296 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFSDQ2M296 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms