Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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RTN1Q16799 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN1Q16799 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
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