Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LAMA3Q16787 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA3Q16787 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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