Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTF1Q16619 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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