Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
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