Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
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