Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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SSX1Q16384 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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SSX1Q16384 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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SSX1Q16384 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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SSX1Q16384 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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