Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK4Q16099 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms