Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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