Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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