Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRKQ15262 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
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