Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
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