Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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PDK1Q15118 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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PDK1Q15118 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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PDK1Q15118 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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PDK1Q15118 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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PDK1Q15118 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDK1Q15118 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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PDK1Q15118 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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PDK1Q15118 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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PDK1Q15118 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK1Q15118 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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