Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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