Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCLAFQ15004 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCLAFQ15004 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCLAFQ15004 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCLAFQ15004 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCLAFQ15004 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCLAFQ15004 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCLAFQ15004 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCLAFQ15004 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCLAFQ15004 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCLAFQ15004 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCLAFQ15004 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCLAFQ15004 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCLAFQ15004 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PCLAFQ15004 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCLAFQ15004 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCLAFQ15004 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PCLAFQ15004 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCLAFQ15004 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCLAFQ15004 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCLAFQ15004 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCLAFQ15004 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PCLAFQ15004 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCLAFQ15004 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCLAFQ15004 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCLAFQ15004 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCLAFQ15004 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCLAFQ15004 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCLAFQ15004 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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