Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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COL19A1Q14993 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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COL19A1Q14993 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
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COL19A1Q14993 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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COL19A1Q14993 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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COL19A1Q14993 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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COL19A1Q14993 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
COL19A1Q14993 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
COL19A1Q14993 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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COL19A1Q14993 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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COL19A1Q14993 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL19A1Q14993 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
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COL19A1Q14993 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COL19A1Q14993 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COL19A1Q14993 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COL19A1Q14993 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
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COL19A1Q14993 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COL19A1Q14993 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
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COL19A1Q14993 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL19A1Q14993 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COL19A1Q14993 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20■□□□□ 0.79
COL19A1Q14993 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL19A1Q14993 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL19A1Q14993 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL19A1Q14993 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL19A1Q14993 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL19A1Q14993 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL19A1Q14993 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL19A1Q14993 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL19A1Q14993 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL19A1Q14993 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL19A1Q14993 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL19A1Q14993 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL19A1Q14993 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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