Protein–RNA interactions for Protein: Q14781

CBX2, Chromobox protein homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX2Q14781 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBX2Q14781 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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