Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA9Q13797 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA9Q13797 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms