Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ATP1A4Q13733 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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